2021年南京大學碩士研究生招生專業詳見《南京大學2021年碩士研究生招生專業目錄》。全國統考科目：思想政治理論、數學（一、二、三），非外國語言文學專業的英語一、英語二、日語、俄語，臨床醫學綜合能力（西醫）、管理類聯考綜合能力、法律碩士聯考的試題、教育學專業基礎綜合、心理學專業基礎綜合、經濟類綜合能力、計算機學科專業基礎綜合。試題由教育部考試中心統一命題。

自命題科目：學校根據教育部《2021年全國碩士研究生招生工作管理規定》(教學函〔2020〕8號)、《全國碩士研究生招生考試自命題工作指導規范》（教學廳〔2019〕12號）等文件精神，研究生初試科目按一級學科命題為主。各專業考試科目詳見《南京大學 2021 年碩士研究生招生專業目錄》。