1.工商管理碩士MBA

工商管理碩士（（Master Of Business Administration，簡稱MBA）專業(yè)學(xué)位教育主要培養(yǎng)能夠勝任工商企業(yè)和經(jīng)濟管理部門高層管理工作需要的復(fù)合型和應(yīng)用型高層次管理人才，注重在掌握生產(chǎn)、財務(wù)、金融、營銷、經(jīng)濟法規(guī)、國際商務(wù)等多學(xué)科知識和管理技能的基礎(chǔ)上，培養(yǎng)把握全局的戰(zhàn)略思維能力和敏銳思考、判斷和處理問題的能力，使之在風(fēng)云變幻的商業(yè)競爭中更具職業(yè)競爭實力。

2009年，新疆大學(xué)獲批MBA專業(yè)學(xué)位授權(quán)點，至今已形成具有一定特色積淀的培養(yǎng)體系，培養(yǎng)的MBA學(xué)員大多成長為中央駐疆企業(yè)、新疆本地國有企業(yè)及民營企業(yè)的中高層管理人員，為新疆經(jīng)濟社會發(fā)展提供了有力的管理人才支撐。

2.會計碩士MPAcc

會計碩士（Master of Professional Accounting，簡稱MPAcc），直接面向職業(yè)需求，培養(yǎng)具有良好職業(yè)道德、進取精神和創(chuàng)新意識，能夠熟練運用現(xiàn)代會計、財務(wù)、審計等相關(guān)領(lǐng)域?qū)I(yè)知識解決實際問題的高素質(zhì)、應(yīng)用型、國際化的會計專門人才，其服務(wù)行業(yè)領(lǐng)域廣泛，涵蓋政府部門，大中型企業(yè)、事業(yè)單位，銀行、證券、投資、保險等金融機構(gòu)，以及會計師事務(wù)所、咨詢公司、資產(chǎn)評估公司等中介機構(gòu)。

2019年，新疆大學(xué)獲批MPAcc專業(yè)學(xué)位授權(quán)點，2020年首次招生。本專業(yè)學(xué)位以新疆大學(xué)工商管理、理論經(jīng)濟學(xué)一級學(xué)科及其他相關(guān)學(xué)科為支撐，在培養(yǎng)過程中突出理論教學(xué)和案例診斷相結(jié)合，同時聘請了一批區(qū)內(nèi)外知名院校師資和企業(yè)家導(dǎo)師參與培養(yǎng)和實踐指導(dǎo)，形成了具有鮮明特色的培養(yǎng)體系。

3.公共管理碩士MPA

公共管理碩士(Master of Public Administration，簡稱MPA)是為適應(yīng)社會公共管理現(xiàn)代化、科學(xué)化和專業(yè)化的要求而設(shè)立的一種專業(yè)學(xué)位，主要為黨政機關(guān)、事業(yè)單位及公共機構(gòu)培養(yǎng)德才兼?zhèn)洹⑦m應(yīng)社會主義現(xiàn)代化建設(shè)需要的高層次、應(yīng)用型、復(fù)合型管理人才。本專業(yè)學(xué)位要求研究生掌握公共管理分析方法及技術(shù)，理解公共管理研究范式及其本身的內(nèi)在規(guī)律，熟悉具體領(lǐng)域的政策、管理與治理，運用公共管理的視角在公共管理實踐中發(fā)現(xiàn)問題、分析問題和解決問題。

2003年，新疆大學(xué)獲批MPA專業(yè)碩士學(xué)位授權(quán)點，是全國第二批獲批MPA專業(yè)碩士學(xué)位的高校，經(jīng)過十多年的發(fā)展，已經(jīng)形成了一支結(jié)構(gòu)合理、教學(xué)水平較高、科研實力較強的師資隊伍，在全疆及西北地區(qū)具有較大的影響力。

4.工程管理碩士MEM

工程管理碩士（Master of Engineering Management，簡稱MEM）是為適應(yīng)我國現(xiàn)代工程事業(yè)發(fā)展對工程管理人才的迫切需求，完善工程管理人才培養(yǎng)體系，創(chuàng)新工程管理人才培養(yǎng)模式，提高我國工程管理的人才質(zhì)量而設(shè)置的一種專業(yè)學(xué)位，突出工程與管理學(xué)科相結(jié)合，重視運用團隊學(xué)習(xí)、案例分析、現(xiàn)場研究、項目訓(xùn)練等方法，培養(yǎng)能獨立擔(dān)負工程管理工作，具有分析和創(chuàng)造性解決實際問題能力的高層次、應(yīng)用型工程管理專門人才。

2015年，新疆大學(xué)MEM開始招生（含全日制和非全日制）。在統(tǒng)籌和共享新疆大學(xué)跨學(xué)院、跨學(xué)科優(yōu)勢師資及教學(xué)資源的基礎(chǔ)上，聘請眾多來自相關(guān)行業(yè)的資深實踐專家，業(yè)已形成一支具有較強科研能力和實踐經(jīng)驗的“雙導(dǎo)師型”師資隊伍，并在課程體系、平臺建設(shè)、能力培養(yǎng)等方面具有較為顯著的區(qū)位優(yōu)勢。

5.旅游管理碩士MTA

旅游管理碩士(Master of Tourism Administration，簡稱MTA)是在我國旅游業(yè)迅速發(fā)展的大背景下，為適應(yīng)我國旅游業(yè)發(fā)展對旅游管理專門人才的迫切需要，完善旅游管理人才培養(yǎng)體系，創(chuàng)新旅游管理人才培養(yǎng)模式，提高旅游管理人才培養(yǎng)質(zhì)量，經(jīng)國務(wù)院學(xué)位委員會于2010年3月批準設(shè)置的一種專業(yè)學(xué)位，主要培養(yǎng)具有社會責(zé)任感和旅游職業(yè)素養(yǎng)、具備國際化視野和戰(zhàn)略思維能力、能夠勝任現(xiàn)代旅游業(yè)實際工作的復(fù)合型管理人才。

2011年，新疆大學(xué)獲批全國首批、新疆唯一MTA專業(yè)學(xué)位授權(quán)點。本專業(yè)學(xué)位以馬克思主義思想為指導(dǎo)，堅持國際視野和實踐創(chuàng)新，結(jié)合新疆旅游發(fā)展的實際，不斷向高層次、有特色、綜合應(yīng)用的辦學(xué)方向發(fā)展。目前，已建成一支具有專業(yè)素養(yǎng)高、實踐能力強、與旅游業(yè)界有良好合作關(guān)系的專兼職師資隊伍，建有十余個實習(xí)實踐基地，為培養(yǎng)高層次、應(yīng)用型旅游管理人才提供了良好條件。